El Plan de Emergencias y Contingencias del Paso Fronterizo Arauca, elaborado por INVIMA en 2023, establece directrices para la prevención, protección y atención de emergencias en la sede. Incluye análisis de riesgos, identificación de amenazas, procedimientos de evacuación y cumplimiento de la normativa colombiana en gestión de riesgos y salud ocupacional. Este plan busca salvaguardar la integridad de los trabajadores y los bienes de la entidad ante eventos naturales, tecnológicos y sociales.